نعمتی شاگرد سابق یحیی گل محمدی قصد داشت در نقل و انتقالات زمستانی پرسپولیسی شود اما با مخالفت شدید مهدی رحمتی مواجه شد و این اتفاق با چند ماه تاخیر رخ داد. علی نعمتی بعد از چند روز مذاکره با پرسپولیس به توافق رسید تا در فصل جدید پیراهن پرسپولیس را بر تن کند.
باشگاه پرسپولیس همان روز اول به نعمتی اعلام کرد نمیتواند پولی بابت رضایتنامه پرداخت کند و مدافع جدید پرسپولیس نیز قبول کرد از جیب پول رضایتنامهاش را پرداخت کند. چکی که نعمتی برای دریافت رضایتنامه به باشگاه شهرخودرو داد چند روز پیش پاس شد و باشگاه مشهدی توانست پول را دریافت کند. به این ترتیب نعمتی بدون مشکل میتواند پرسپولیس را همراهی کند.
قرارداد نعمتی با پرسپولیس ۴ میلیارد تومان است و این بازیکن با ۳ میلیاردی که به باشگاه سابقش داد عملا برای فصل آینده تنها یک میلیارد دریافتی خواهد داشت.