مرتضی آقاخان در ابتدای فصل از پیکان با استقلال قرارداد امضا کرد اما در همان روزهای ابتدایی تمرینات مچ پایش آسیب دید و نامش از لیست آبی ها خارج شد.
با این حال آقاخان از امروز تمرینات خود را با حضور در زمین صنایع دفاع آغاز کرد تا خود را برای بازگشت به میادین آماده کند.
آقاخان که اخیرا قرارداد خود را برای ۴ سال با استقلال تمدید کرده است، از نیم فصل دوم نامش به لیست استقلال اضافه می شود و می تواند برای این تیم به میدان برود.