همزمان با تحویل بودجه سال ۹۸ به مجلس شورای اسلامی سهم شورای عالیه حوزههای علمیه، سازمان اوقاف و امور خیریه، سازمان تبلیغات اسلامی و… در حالی مشخص شد که برخی از آنها با ریزش بودجه در قیاس با سال گذسته مواجهه شدهاند. این بخش از بودجه پربحثترین موضوع لایحه سال گذشته نیز بوده است.